Descriptif
Contenu de l'enseignement 1- Introduction module et bases de l'intégration en biologie + distribution articles (cours) 2- Génomique appliquée à la sélection animale (cours) 3- Intégration en ecophysiologie (cours) 4- Approche de mesure des flux métaboliques chez l'homme (cours & & TD) 5- Metagénomique (cours) 6- Intégration et modélisation réseau métabolique des microorganismes (cours) 7- Developpement embryonaire des animaux : images et modèles (cours) 8- TD : De l'image au modèle statistique - exemple de reconstruction 3D d'une cellule et de ses compartiments 9- TD : Intégration transcriptome et protéome chez la plante 10- Approches intégrées en biotechnologie végétale (cours)
Objectifs pédagogiques
Ce module combine des séances de cours fondamentaux à la fois dans les disciplines moléculaires et cellulaires pour illustrer les nouveaux outils et concepts des technologies "OMIQUES", et dans les disciplines de Physiologie et Ecophysiologie pour illustrer les approches aux échelles de l'organisme et de la population. Des conférences illustrent certains aspects plus précis de l'intégration au travers de questions de biologie spécifiques. Une introduction à la modélisation sera proposée. Les notions introduites au travers des cours et conférences sont développées dans des séances de TD où les étudiants pourront se confronter à l'utilisation de différents outils informatiques et bases de données. Les étudiants seront amenés à traiter des jeux de données provenant des systèmes microbiens, végétaux et animaux pour les interpréter et les modéliser. Cette UC est associée à l'UC3 "Initiation à la biologie de synthèse". Ces deux UC sont complémentaires, l'un traitant plus des aspects biologie des systèmes et modélisation (BI) et l'autre les aspects de biologie de synthèse et d'ingénierie.
37 heures en présentiel
6 heures de travail personnel estimé pour l’étudiant.
effectifs minimal / maximal:
10/30Diplôme(s) concerné(s)
UE de rattachement
- S1-4-2A-UEchoixS1 : UE à choix Semestre 1
Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, cellulaire et biochimie.
Format des notes
Numérique sur 20Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Vos modalités d'acquisition :
La validation du module est basée sur l'exposé d'un article récent de biologie intégrative (au choix) à étudier durant le module.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2.5
Pour les étudiants du diplôme Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2.5
Pour les étudiants du diplôme Accueilli Athens
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2.5
Programme détaillé