v2.8.0 (4286)

Enseignement scientifique et technique - UC6-13 : Modélisation de la dynamique des épidémies dans les populations végétales et animales

Domaine > Productions durables, filières, territoires, Ingénierie et santé : homme, bioproduits, environnement, Gestion et ingénierie de l'environnement.

Descriptif

Les cours permettront d'aborder à la fois les différentes notions associées à la propagation d'agents pathogènes : - notion de taux de reproduction de base du parasite et de prévalence - modes de transmission (direct/indirect, vertical/horizontal, densité-dépendant/ fréquence-dépendant, …) - immunisation, temps de latence - prise en compte de l'espace : vague d'infection - résistance/virulence, coévolution et les aspects méthodologiques : - méthode d'étude des systèmes dynamiques (équilibre, stabilité locale) - modèles structurés en âge ou en classes d'âge - modèles de diffusion. Les séances de travaux dirigés permettront aux étudiants de se familiariser avec les éléments vus en cours. Les exercices proposés lors de ces séances prendront plusieurs formes : - constructions et études analytiques de modèles - simulations avec les logiciels Populus et Matlab - analyses d'articles basés sur des cas concrets Enfin, des chercheurs viendront présenter des travaux concernant la modélisation de la propagation de maladies infectieuses chez les végétaux et les animaux. Ces conférences permettront non seulement aux étudiants d'avoir une illustration concrète, dans le cadre de recherches fondamentales ou appliquées, de l'utilisation des concepts et des outils vus en cours et en TD, mais aussi de découvrir d'autres façons d'aborder la modélisation en épidémiologie (modèles individu-centrés, réseaux de Pétri, …)

Objectifs pédagogiques

Dans cette UV, les étudiants verront comment on peut utiliser certains concepts et outils mathématiques de l'écologie (et plus particulièrement ceux développés dans le cadre de la dynamique des populations) pour construire des modèles prédictifs et explicatifs de la propagation dans le temps et dans l'espace des épidémies dans les populations végétales et animales, et l'utilisation qui peut être faite de ces modèles pour orienter les stratégies de contrôle des épidémies.

effectifs minimal / maximal:

8/24

Diplôme(s) concerné(s)

UE de rattachement

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Enseignement d'ASD et d'écologie des populations et communautés du tronc commun de 1ère année

Format des notes

Numérique sur 20

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Vos modalités d'acquisition :

Poster à partir d'un analyse d'article (par binôme)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 1.5

Pour les étudiants du diplôme Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 1.5

Programme détaillé

 

Mots clés

modélisation, systèmes dynamiques, modèles SIR, modes de transmission, vecteurs, prévalence, résistance, prophylaxie, coévolution

Support pédagogique multimédia

Oui

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