v2.8.0 (4333)

Enseignement scientifique et technique - UC1-05 : Biologie intégrative, introduction à la complexité du vivant

Domaine > Sciences de la Vie et Santé, Ingénierie et santé : homme, bioproduits, environnement.

Descriptif

Contenu de l'enseignement 1- Introduction module et bases de l'intégration en biologie + distribution articles (cours), 2- Génomique appliquée à la sélection animale (cours), 3- Intégration en ecophysiologie (cours), 4- Approche de mesure des flux métaboliques chez l'homme (cours & TD),  5- Intégration et modélisation réseau métabolique des microorganismes (TD),  6- Acquisition image confocale (démonstration) et analyse d'image (TD), 7- TD : De l'image au modèle statistique - exemple de reconstruction 3D d'une cellule et de ses compartiments, 8- TD : Intégration transcriptome et protéome chez la plante, 9- Approches intégrées en biotechnologie végétale (cours)

Objectifs pédagogiques

Ce module combine des séances de cours fondamentaux à la fois dans les disciplines moléculaires et cellulaires pour illustrer les nouveaux outils et concepts des technologies "OMIQUES", et dans les disciplines de Physiologie et Ecophysiologie pour illustrer les approches aux échelles de l'organisme et de la population. Des conférences illustrent certains aspects plus précis de l'intégration au travers de questions de biologie spécifiques. Une introduction à la modélisation sera proposée. Les notions introduites au travers des cours et conférences sont développées dans des séances de TD où les étudiants pourront se confronter à l'utilisation de différents outils informatiques et bases de données. Les étudiants seront amenés à traiter des jeux de données provenant des systèmes microbiens, végétaux et animaux pour les interpréter et les modéliser. Cette UC est associée à l'UC3 "Initiation à la biologie de synthèse". Ces deux UC sont complémentaires, l'un traitant plus des aspects biologie des systèmes et modélisation (BI) et l'autre les aspects de biologie de synthèse et d'ingénierie.

37 heures en présentiel

Soit 6 heures de travail global estimé pour l’étudiant.

effectifs minimal / maximal:

10/15

Diplôme(s) concerné(s)

UE de rattachement

domaines ParisTech

Biologie, Sciences animales, Sciences végétales.

domaines Saclay

Biodiversité, Agriculture et alimentation, Société, environnement, Biologie, médecine, pharmacie.

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, cellulaire et biochimie.

Pour les étudiants du diplôme Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)

Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, cellulaire et biochimie.

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, cellulaire et biochimie.

Format des notes

Numérique sur 20

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Vos modalités d'acquisition :

La validation du module est basée sur l'exposé d'un article récent de biologie intégrative (au choix) à étudier durant le module.

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 2.5

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 2.5

Pour les étudiants du diplôme Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 2.5

Programme détaillé

 

Mots clés

Génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, Physiologie et génétiqueBiologie cellulaire et morphogénèseAnalyse comparée et modélisation

Méthodes pédagogiques

Cours et TD pratique. Deux jours de TD seront réalisés à l'INRA de Versailles avec une visite de la plateformes d'imagerie et de cytologie.
Veuillez patienter