Descriptif
Initiation à quelques méthodes de la modélisation moléculaire : -représentation des molécules -champs de force -dynamique moléculaire -docking
Objectifs pédagogiques
Sensibiliser au développement et à l'intérêt des méthodes de modélisation moléculaire, en insistant sur la mécanique moléculaire.
18 heures en présentiel
6 heures de travail personnel estimé pour l’étudiant.
effectifs minimal / maximal:
6/12Diplôme(s) concerné(s)
- Ingénieur AgroParisTech
- Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)
- Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
UE de rattachement
- S1-6-2A-UEchoix : UE à choix Semestre 1
Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Ne pas avoir peur d'utiliser un ordinateur
Format des notes
Numérique sur 20Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Vos modalités d'acquisition :
La plupart des notions sont abordées pendant un rapide exposé théorique puis immédiatement appliquées en salle informatique.
L'évaluation tient compte de la participation et de la réalisation d'une simulation confiée à chaque étudiant.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2
Programme détaillé
L'application des méthodes de modélisation sera restreinte aux systèmes biologiques et aux fluides : les polymères, les solides ne seront pas abordés.
Mots clés
chimio-informatique , modélisation moléculaire , mécanique moléculaire , docking.Méthodes pédagogiques
Alternance de brefs cours avec mise en oeuvre immédiate sur poste informatiqueSupport pédagogique multimédia