2.12.8 (552)

Enseignement scientifique et technique - BIOTECH_UE_INEMI : Les interactions entre micro-organismes

Descriptif

Candida albicans est une levure pathogène opportuniste présente chez 80% de la population. Outre des infections superficielles, Candida peut causer des infections profondes disséminées chez les patients immunodéficients qui conduisent à la mort dans 40% des cas. De nombreux facteurs prédisposent à la pathogénie de cette levure, parmi ceux-ci des protéines de surface qui vont permettre l’adhésion et favoriser la formation de biofilms. Ces protéines pourraient constituer des cibles potentielles pour le développement de traitements ; cependant une grande majorité d’entre elles restent à caractériser.

Afin de tester le rôle de ces protéines de surface de C. albicans dans ses capacités à adhérer à certaines surfaces ou à interagir avec d'autres micro-organismes, des souches recombinantes de S. cerevisiae exprimant en surface (surface display) des protéines de C. albicans ont été construites. Ces souches recombinantes seront caractérisées (immunolocalisation des protéines hétérologues et analyse des modifications éventuelles des propriétés de surface), puis testées quant à leur capacité à : (i) adhérer à des surfaces abiotiques, (ii) agréger en présence d’autres cellules, (iii) former des biofilms seules ou en présence de bactérie(s) en microplaques.

Cette UC comportera principalement des Travaux Pratiques dans lesquels de nombreuses techniques : immunofluorescence sur cellules, tests d’adhésion au polystyrène et de formation de biofilms, tests d'agrégation cellule-cellule, tests d'inhibition de croissance, propriétés de surface des cellules… seront développées.

Objectifs pédagogiques

L’objectif est d’identifier quelles méthodes permettent au mieux de répondre à une question posée dans le cadre d’un projet de recherche afin de caractériser le type de relations que les micro-organismes peuvent établir avec leur environnement (surfaces abiotiques ou autres micro-organismes) et d'identifier les déterminants impliqués.

42 heures en présentiel
réparties en:
  • Accueil : 1
  • Evaluation : 6
  • Travail personnel : 2
  • TP : 39

effectifs minimal / maximal:

2/24

Diplôme(s) concerné(s)

Parcours de rattachement

Domaine disciplines/enjeux/objets

Microorganisme, Biologie, Biotechnologies, Compréhension du vivant, Microbiologie, Physiologie.

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Aucun

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Aucun

Format des notes

Numérique sur 20

Littérale/grade européen

Pour les étudiants du diplôme MASTER - BIOLOGIE INTEGRATIVE ET PHYSIOLOGIE

Pour les étudiants du diplôme Accueillis en master (erasmus et autres prog.)

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Vos modalités d'acquisition :

Compensable avec les autres UE à choix BIOTECH

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12
L'UE est acquise si Note finale >= 10
  • Crédits ECTS acquis : 2 ECTS

Le coefficient de l'UE est : 2

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Vos modalités d'acquisition :

Compensable avec les autres UE à choix BIOTECH

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12
L'UE est acquise si Note finale >= 10
  • Crédits ECTS acquis : 2 ECTS

Le coefficient de l'UE est : 2

Programme détaillé

L'UE est composé de 13 séances de travaux pratiques de 3h, réalisées en binôme ou trinôme. Elle démarre par une présentation du sujet et se termine par la réalisation de poster par les groupes d'élèves.

La capacité de différents micro-organismes à adhérer à une surface abiotique (le polystyrène) et à former des biofilms seuls sera testée. Il sera demandé d'évaluer l'effet de la présence de la bactérie sur les propriétés d'adhésion de la levure : y a-t-il synergie ou compétition ? Les 2 microorganismes coopèrent-ils ou au contraire l'adhésion de l'un est-elle diminuée en présence de l'autre ?

Suite à ces premières observations, un fil d'Ariane est déroulé pour comprendre les interactions que les 2 microorganismes nouent ensemble. Différentes expérimentations seront mises en oeuvre pour tester les hypothèses de travail.

Mots clés

Levures, bactéries, expression en surface, adhésion, agrégation, biofilm, interaction

Méthodes pédagogiques

Expérimentales

Support pédagogique multimédia

Oui

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