Descriptif
Ce module permettra aux étudiants de se confronter à l'analyse de données complexes obtenues par des travaux expérimentaux.
Afin d’apprendre à gérer la complexité des jeux de données et à mettre en œuvre des méthodes statistiques pour répondre à différentes questions biologiques, le module s’articulera autour de trois axes :
- Axe 1 : Identification des relations biologiques
- Axe 2 : Modélisation des interactions biologiques
- Axe 3 : Prédiction
Ces trois axes permettront de consolider les acquis de 1ère et de 2ème année (statistiques descriptives, les tests statistiques et modèle linéaire) et d’élargir les compétences des étudiants vers des méthodes plus avancées (tests multiples, réseaux bayésiens, modèles à effets mixtes).
Chacun des axes s’articulera autour de cours et de travaux dirigés qui s’appuient sur différents jeux de données et sur l’utilisation du logiciel R. Les jeux données, les études scientifiques ayant conduit à l’acquisition de ces données, et les questions biologiques associées auxquelles ils permettent de répondre seront présentés en introduction de chaque axe.
Afin d’illustrer différentes applications des modèles statistiques dans un contexte de recherche, des articles scientifiques seront discutés lors de séances de journal club (une séance par axe).
Une évaluation en fin de module permettra d'apprécier la maîtrise des concepts et des méthodes abordés. La note finale sera complétée par une modulation tenant compte de l'assiduité, de l'implication et de la participation active des étudiants au cours des journal club et des travaux dirigés.
Objectifs pédagogiques
- Consolider les acquis en statistiques et apprendre de nouvelles méthodes de statistiques
- Identifier des méthodes statistiques adaptées pour répondre à différentes questions biologiques
- Analyser des jeux de données complexes issus de travaux expérimentaux
effectifs minimal / maximal:
8/20Diplôme(s) concerné(s)
- MASTER - Biologie-AgroSciences
- Accueillis en master (erasmus et autres prog.)
- Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
- Diploma in Biological and Chemical Engineering for a Sustainable Bioeconomy (Bioceb) / Diplôme en Ingénierie Chimique et Biologique pour une Bioéconom
- Ingénieur AgroParisTech
Parcours de rattachement
Domaine disciplines/enjeux/objets
Système d'information - Modélisation.Format des notes
Numérique sur 20Littérale/grade européenPour les étudiants du diplôme MASTER - Biologie-AgroSciences
Pour les étudiants du diplôme Accueillis en master (erasmus et autres prog.)
Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Vos modalités d'acquisition :
Présentation orale et compte-rendu écrit sur le travail personnel réalisé.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
- Crédits ECTS acquis : 2 ECTS
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Vos modalités d'acquisition :
Présentation orale et compte-rendu écrit sur le travail personnel réalisé.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
- Crédits ECTS acquis : 2 ECTS
Le coefficient de l'UE est : 2