Descriptif
Initiation à quelques méthodes de la modélisation moléculaire :
- représentation des molécules
- champs de force
- dynamique moléculaire
- docking
Objectifs pédagogiques
Sensibiliser au développement et à l'intérêt des méthodes de modélisation moléculaire, en insistant sur la mécanique moléculaire.
18 heures en présentiel
6 heures de travail personnel estimé pour l’étudiant.
effectifs minimal / maximal:
6/16Diplôme(s) concerné(s)
- MASTER - ECONOMIE DE L'ENVIRONNEMENT, DE L'ENERGIE ET DES TRANSPORTS
- MASTER - NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS
- Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
- Accueillis IAE forestiers (élèves de l'Institut Agro Dijon)
- Ingénieur AgroParisTech
UE de rattachement
- M1 ATHENS AGROPT30 : Modélisation moléculaire,
- 2A-UEchoix-S1 : UE à choix Semestre 1
Domaine disciplines/enjeux/objets
Biologie, Système d'information - Modélisation.Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Ne pas avoir peur d'utiliser un ordinateur
Format des notes
Numérique sur 20Pour les étudiants du diplôme MASTER - ECONOMIE DE L'ENVIRONNEMENT, DE L'ENERGIE ET DES TRANSPORTS
Le rattrapage est autoriséLe coefficient de l'UE est : 1
Pour les étudiants du diplôme Accueillis IAE forestiers (élèves de l'Institut Agro Dijon)
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme MASTER - NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS
Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 7
Le coefficient de l'UE est : 1
Programme détaillé
L'application des méthodes de modélisation sera restreinte aux systèmes biologiques et aux fluides : les polymères, les solides ne seront pas abordés.
Mots clés
chimio-informatique , modélisation moléculaire , mécanique moléculaire , docking.Méthodes pédagogiques
Alternance de brefs cours avec mise en oeuvre immédiate sur poste informatiqueSupport pédagogique multimédia