Descriptif
Initiation à quelques méthodes de la modélisation moléculaire :
- représentation des molécules
- champs de force
- dynamique moléculaire
- docking
Objectifs pédagogiques
Sensibiliser au développement et à l'intérêt des méthodes de modélisation moléculaire, en insistant sur la mécanique moléculaire.
18 heures en présentiel
6 heures de travail personnel estimé pour l’étudiant.
effectifs minimal / maximal:
6/12Diplôme(s) concerné(s)
- Ingénieur AgroParisTech
- Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
- Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)
UE de rattachement
- 2A-UEchoix-S1 : UE à choix Semestre 1
domaines ParisTech
Biologie, Système d'information - Modélisation.Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Ne pas avoir peur d'utiliser un ordinateur
Format des notes
Numérique sur 20Pour les étudiants du diplôme Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Vos modalités d'acquisition :
La plupart des notions sont abordées pendant un rapide exposé théorique puis immédiatement appliquées en salle informatique.
L'évaluation tient compte de la participation et de la réalisation d'une simulation confiée à chaque étudiant.
Le coefficient de l'UE est : 2
Programme détaillé
L'application des méthodes de modélisation sera restreinte aux systèmes biologiques et aux fluides : les polymères, les solides ne seront pas abordés.
Mots clés
chimio-informatique , modélisation moléculaire , mécanique moléculaire , docking.Méthodes pédagogiques
Alternance de brefs cours avec mise en oeuvre immédiate sur poste informatiqueSupport pédagogique multimédia