Descriptif
Contenu de l'enseignement 1- Introduction module et bases de l'intégration en biologie + distribution articles (cours), 2- Génomique appliquée à la sélection animale (cours), 3- Intégration en ecophysiologie (cours), 4- Approche de mesure des flux métaboliques chez l'homme (cours & TD), 5- Intégration et modélisation réseau métabolique des microorganismes (TD), 6- Acquisition image confocale (démonstration) et analyse d'image chez les plantes (TD), 7- TD : De l'image au modèle statistique - exemple de reconstruction 3D d'une cellule et de ses compartiments, 8- TD : Intégration transcriptome et protéome chez la plante, 9- Approches intégrées en biotechnologie végétale (cours)
Objectifs pédagogiques
Ce module combine des séances de cours fondamentaux à la fois dans les disciplines moléculaires et cellulaires pour illustrer les nouveaux outils et concepts des technologies "OMIQUES", et dans les disciplines de Physiologie et Ecophysiologie pour illustrer les approches aux échelles de l'organisme et de la population. Des conférences illustrent certains aspects plus précis de l'intégration au travers de questions de biologie spécifiques. Une introduction à la modélisation sera proposée. Les notions introduites au travers des cours et conférences sont développées dans des séances de TD où les étudiants pourront se confronter à l'utilisation de différents outils informatiques et bases de données. Les étudiants seront amenés à traiter des jeux de données provenant des systèmes microbiens, végétaux et animaux pour les interpréter et les modéliser. Cette UC est associée à l'UC3 " Initiation à la biologie de synthèse". Ces deux UC sont complémentaires, l'un traitant plus des aspects biologie des systèmes et modélisation (BI) et l'autre les aspects de biologie de synthèse et d'ingénierie.
37 heures en présentiel
6 heures de travail personnel estimé pour l’étudiant.
effectifs minimal / maximal:
10/20Diplôme(s) concerné(s)
- Ingénieur AgroParisTech
- Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
- Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)
UE de rattachement
- 2A-UEchoix-S1 : UE à choix Semestre 1
domaines ParisTech
Biologie, Sciences animales, Sciences végétales.domaines Saclay
Biodiversité, Agriculture et alimentation, Société, environnement, Biologie, médecine, pharmacie.Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, génétique cellulaire et biochimie.
Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, génétique cellulaire et biochimie.
Pour les étudiants du diplôme Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)
Les cours requièrent des connaissances de base en biologie moléculaire, génétique cellulaire et biochimie.
Format des notes
Numérique sur 20Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2.5
Pour les étudiants du diplôme Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2.5
Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Vos modalités d'acquisition :
La validation du module est basée sur l'exposé d'un article récent de biologie intégrative (au choix) à étudier durant le module.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2.5
Pour les étudiants du diplôme MASTER - NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS
Programme détaillé