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v2.11.0 (5515)

Enseignement scientifique et technique - UC3-01 : Initiation à la biologie de synthèse

Domaine > Ouverture et culture générale, Département Modélisation Mathématique, Informatique et Physique, Département Sciences de la Vie et Santé, Domaine Productions durables, filières, territoires, Domaine Ingénierie et santé : homme, bioproduits, environnement.

Descriptif

Génomique et post-génomique. Rappel sur les méthodologies de séquençage et d'analyse des génomes. Approches globales du fonctionnement des génomes : transcriptome, protéome, métabolome, interactome, … Introduction à la biologie des systèmes. Flux métaboliques et MCA. Différents types de modélisation (métabolique vs cinétique) Approches « top down » vs. « bottom up ». Biologie de synthèse et biotechnologie. Illustration des différentes approches par des travaux pratiques en biologie de synthèse et des visites de laboratoires à l'INRA de Jouy-en-Josas. Située en aval de l'UC Biologie Intégrative, cette UC a été pensée pour être complémentaire en apportant un volet appliqué via des aspects d'ingénierie métabolique et de biologie de synthèse.

Objectifs pédagogiques

Le but de l'unité est de familiariser les étudiants avec les problématiques, le langage et les méthodologies utilisées pour l'analyse et l'interprétation des données génomiques et post-génomiques. Il est aussi de leur donner des aperçus sur les perspectives qu'ouvrent ces approches tant pour l'analyse de grands problèmes biologiques (fonctionnement intégré des cellules par exemple) que pour des applications dans divers domaines. Il est enfin de les faire réfléchir sur les applications de la biologie de synthèse, sur les interprétations qui en sont faites et sur les questions d'éthique qui en résultent.

45.5 heures en présentiel
réparties en:
  • Evaluation : 4
  • Travail personnel : 7.5
  • TD : 16
  • CM : 18

7.5 heures de travail personnel estimé pour l’étudiant.

effectifs minimal / maximal:

6/18

Diplôme(s) concerné(s)

UE de rattachement

domaines ParisTech

Biologie, Système d'information - Modélisation.

domaines Saclay

Ingénierie, sciences et technologies de l’information.

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Aucun pré-requis n'est spécifiquement nécessaire pour cette unité. Cependant un goût pour les travaux pratiques et la biologie de synthèse constituera un avantage. La participation à l'UC1 Biologie Intégrative n'est pas requise, mais apporte des enseignements complémentaires de cette unité.

Pour les étudiants du diplôme MASTER - BIOLOGIE INTEGRATIVE ET PHYSIOLOGIE

Aucun pré-requis n'est spécifiquement nécessaire pour cette unité. Cependant un goût pour les travaux pratiques et la biologie de synthèse constituera un avantage.

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Aucun pré-requis n'est spécifiquement nécessaire pour cette unité. Cependant un goût pour les travaux pratiques et la biologie de synthèse constituera un avantage. La participation à l'UC1 Biologie Intégrative n'est pas requise, mais apporte des enseignements complémentaires de cette unité.

Pour les étudiants du diplôme Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)

Aucun pré-requis n'est spécifiquement nécessaire pour cette unité. Cependant un goût pour les travaux pratiques et la biologie de synthèse constituera un avantage. La participation à l'UC1 Biologie Intégrative n'est pas requise, mais apporte des enseignements complémentaires de cette unité.

Format des notes

Numérique sur 20

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Vos modalités d'acquisition :

Les TP/TD seront restitués sous la forme d'un compte rendu et les élèves réaliseront une analyse d'articles qu'ils exposeront oralement (travail en groupe)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 2.5

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Vos modalités d'acquisition :

Les TP/TD seront restitués sous la forme d'un compte rendu et les élèves réaliseront une analyse d'articles qu'ils exposeront oralement (travail en groupe)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 2.5

Pour les étudiants du diplôme Accueillis IAE forestiers (ingénieurs de l'Institut Agro Dijon)

Vos modalités d'acquisition :

Les TP/TD seront restitués sous la forme d'un compte rendu et les élèves réaliseront une analyse d'articles qu'ils exposeront oralement (travail en groupe)

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 2.5

Pour les étudiants du diplôme MASTER - BIOLOGIE INTEGRATIVE ET PHYSIOLOGIE

Programme détaillé

Cours et conférences, TD de design génétique et de modélisation métabolique, TP et visite de laboratoires de recherche en génomique & protéomique sur le centre INRAE de Jouy en Josas (unité MICALIS).

Mots clés

Séquençage à très haut débit, approches globales appliquées à l'ingénierie métabolique, microbiologie, biologie de synthèse, biotechnologies

Méthodes pédagogiques

Cours et conférences, TD , TP et visite de laboratoires de recherche en génomique & protéomique sur le centre INRAE de Jouy en Josas (unité MICALIS).
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