v2.11.0 (5515)

Enseignement scientifique et technique - UC6-17 : Polymorphismes des populations humaines et facteurs de prédisposition

Domaine > Ouverture et culture générale, Domaine Ingénierie et santé : homme, bioproduits, environnement.

Descriptif

La variabilité génétique humaine, en plus d’être à la base de certaines maladies et de phénotypes tels les groupes sanguins, contribue à la variété de nos réponses à notre environnement : aux agents pathogènes, à des drogues utilisées en médecine, à ce qu’on mange ...  En grande partie grâce aux nouvelles techniques qui ont été développées pour profiter de la révolution du séquençage génomique, dans les domaines de la biologie moléculaire et de l’acquisition et traitement de données, l’étude du polymorphisme génétique humain a connu récemment de grandes avancées.  En plus du développement de techniques optimisées pour la réalisation de ces analyses, les résultats ont trouvé des applications dans des domaines variés.  Nous traitons dans ce module des techniques de l’étude des polymorphismes et des applications de ses résultats.

Cette unité d'enseignement est destinée à ceux qui veulent approfondir leurs connaissances en génétique humaine.  Les sujets couverts incluent : introduction au génome humain, les bases biologiques des polymorphismes génétiques, leurs spécificités (Single Nucleotide Polymorphisme (SNP), Copy Number Variant (CNV), micro-, et mini-satellite, SINE …), leurs origines et fréquences, leur maintien dans la population, et leur place dans l'évolution et dans la diversité génétique d’Homo sapiens.  Nous présenterons les techniques génomiques de détection des polymorphismes, l’analyse et la représentation de ces données.  Le thème central à l’enseignement est la recherche de polymorphismes et leur association à un phénotype : marqueur ou mutation causale dans un phénotype, analyses familiales, pénétrance, déséquilibre de liaison et étude d'association pan-génomique (WGAS).  Des exemples concrets seront présentés de l'utilisation de ces nouvelles techniques en médecine, en pharmacogénomique, et en ethnobiologie.

 

Objectifs pédagogiques

L’enseignement a été conçu pour donner un vue générale des concepts importantes dans la pratique actuelle de la génétique humaine en ce qui concerne la détection et l’analyse des polymorphismes.  Les objectifs pédagogiques sont :

 - de connaître les bases moléculaires des polymorphismes génétiques chez l'humain, leurs fréquences, leurs natures et genèses.

 - de connaître les techniques de mise en évidence des polymorphismes, l’analyse génétique ou génomique des polymorphismes et un échantillon de ses diverses applications.

 - de découvrir et comprendre les domaines d'utilisation et d’apprécier leurs limites.

Le but est de permettre à l'étudiant d’appréhender les bases scientifiques de l’analyse des polymorphismes génétiques humains, et d’en évaluer les conclusions.  Ce module servira de base pour ceux qui veulent développer leurs compétences en génétique humaine dans la perspective d’un rôle consultatif ou dans un projet professionnel de recherche fondamentale ou appliquée.

effectifs minimal / maximal:

8/20

Diplôme(s) concerné(s)

UE de rattachement

Format des notes

Numérique sur 20

Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech

Vos modalités d'acquisition :

L’évaluation sera basée sur un exposé des résultats d'un projet bibliographique effectué par les étudiants en binômes ou en trinômes.

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 1.5

Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)

Vos modalités d'acquisition :

L’évaluation sera basée sur un exposé des résultats d'un projet bibliographique effectué par les étudiants en binômes ou en trinômes.

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 1.5

Pour les étudiants du diplôme Parcours IAE forestier (ingénieur AgroSupDijon)

Vos modalités d'acquisition :

L’évaluation sera basée sur un exposé des résultats d'un projet bibliographique effectué par les étudiants en binômes ou en trinômes.

Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)
  • le rattrapage est obligatoire si :
    Note initiale < 6
  • le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
    6 ≤ note initiale < 12

Le coefficient de l'UE est : 1.5

Programme détaillé

L’enseignement est constitué de cours magistraux et de TD de bioinformatique.  Les cours au début de la semaine apportent quelques bases nécessaires, concepts et spécificités de la génétique humaine, tandis que les TD ont pour sujet l’utilisation des bases de données du génome humain.

Ces concepts sont ensuite développés lors des cours d’intervenants (CNRS, Muséum National d’Histoire Naturelle, Inserm, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Centre National de Génotypage), chercheurs et médecins, spécialistes et professionnels dans leurs domaines : structure et évolution des populations humaines, polymorphismes et prédisposition aux maladies infectieuses, réarrangements, CNV et maladies, analyse génétique de familles, analyses de données pan-génomiques).

Le dernier après-midi est consacré aux présentations des étudiants pour l’évaluation.

Mots clés

polymorphisme génétique, SNP, CNV, génétique d'association, GWAS, marqueur de prédisposition, maladie, pharmacogénomique, ethnobiologie, évolution, humain

Méthodes pédagogiques

Cours magistraux, TD, projet bibliographique
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