Descriptif
Objectifs pédagogiques
Pour la partie statistique :
- Être capable de reconnaître, selon la question biologique et le type de variable à étudier, quel modèle statistique (par exemple : régression logistique, régression de Poisson, régression binomiale, modèle non linéaire, modèle de Cox…) est adapté au problème décrit.
- Être capable d’écrire les modèles sous forme mathématique et énoncer les hypothèses sur lesquels ils reposent.
- Une fois le modèle posé, être capable de conduire correctement l’analyse statistique (validation des hypothèses de modélisation si besoin, test du modèle, tests des effets, comparaison de modèles, etc.) ; l’ingénieur devra en particulier savoir retrouver les différentes étapes de l’analyse sur un listing R et énoncer soigneusement les conclusions statistiques et biologiques associées.
Pour la partie déterministe :
- Etre capable de reconnaître, d’analyser en terme de systèmes dynamiques et d’interpréter des modèles déterministes de diffusion d’épidémie à la fois avec les outils génériques enseignés en première année et les outils d’analyse de stabilité plus spécifiques aux modèles SIR présentés en cours.
- Être capable d’écrire les modèles sous forme mathématique et énoncer les hypothèses sur lesquels ils reposent.
- Être capable de simuler numériquement ce type de systèmes, d’interpréter les résultats obtenus tout en ayant un regard critique sur la qualité de la simulation numérique grâce à la comparaison avec l’analyse théorique précédente.
effectifs minimal / maximal:
35/96Diplôme(s) concerné(s)
UE de rattachement
- 2A-D4 : Domaine "Ingénierie et santé : Homme, bioproduits, environnement"
domaines ParisTech
Biologie, Système d'information - Modélisation.Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
TC AgroParisTech de 1° et 2°année de Statistique et de 1° Année en ASD.
Format des notes
Numérique sur 20Pour les étudiants du diplôme Ingénieur AgroParisTech
Vos modalités d'acquisition :
Compte rendu de TP et examen final.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2
Pour les étudiants du diplôme Accueillis cursus ing 2e et 3e année (erasmus et école)
Vos modalités d'acquisition :
Compte rendu de TP et examen final.
Le rattrapage est autorisé (Max entre les deux notes)- le rattrapage est obligatoire si :
- Note initiale < 6
- le rattrapage peut être demandé par l'étudiant si :
- 6 ≤ note initiale < 12
Le coefficient de l'UE est : 2
Programme détaillé
Cet enseignement complète l’enseignement du tronc commun AgroParisTech dans deux domaines : en Analyse des Systèmes dynamiques en étudiant les modèles déterministes de diffusion d’épidémies (modèles SIR et variantes) et en statistique en étudiant le modèle linéaire généralisé (pour les cas où la variable réponse ou à expliquer est discrète), le modèle de Cox (pour l’analyse de données de survie) et le modèle non linéaire (utilisés par exemple pour étudier des courbes de croissances).
Mots clés
Analyse des Systèmes dynamiques, diffusion d'épidémies, modèle SIR.Modèle linéaire généralisé, regression logistique, épidémiologie, classification non supervisée ou clustering, modèle de CoxMéthodes pédagogiques
Cours et TP en salles informatiquesSupport pédagogique multimédia