Descriptif
Les cours permettront d'aborder à la fois les différentes notions associées à la propagation d'agents pathogènes : - notion de taux de reproduction de base du parasite et de prévalence - modes de transmission (direct/indirect, vertical/horizontal, densité-dépendant/ fréquence-dépendant, …) - immunisation, temps de latence - prise en compte de l'espace : vague d'infection - résistance/virulence, coévolution et les aspects méthodologiques : - méthode d'étude des systèmes dynamiques (équilibre, stabilité locale) - modèles structurés en âge ou en classes d'âge - modèles de diffusion. Les séances de travaux dirigés permettront aux étudiants de se familiariser avec les éléments vus en cours. Les exercices proposés lors de ces séances prendront plusieurs formes : - constructions et études analytiques de modèles - simulations avec les logiciels Populus et Matlab - analyses d'articles basés sur des cas concrets Enfin, des chercheurs viendront présenter des travaux concernant la modélisation de la propagation de maladies infectieuses chez les végétaux et les animaux. Ces conférences permettront non seulement aux étudiants d'avoir une illustration concrète, dans le cadre de recherches fondamentales ou appliquées, de l'utilisation des concepts et des outils vus en cours et en TD, mais aussi de découvrir d'autres façons d'aborder la modélisation en épidémiologie.
Objectifs pédagogiques
Dans cette UE, les étudiants verront comment on peut utiliser certains concepts et outils mathématiques de l'écologie (et plus particulièrement ceux développés dans le cadre de la dynamique des populations) pour construire des modèles prédictifs et explicatifs de la propagation dans le temps et dans l'espace des épidémies dans les populations végétales et animales, et l'utilisation qui peut être faite de ces modèles pour orienter les stratégies de contrôle des épidémies.
effectifs minimal / maximal:
8/24Diplôme(s) concerné(s)
Parcours de rattachement
Domaine Université Paris Saclay
Biodiversité, Agriculture et alimentation, Société, environnement.Format des notes
Numérique sur 20Littérale/grade européenPour les étudiants du diplôme Accueillis en master (erasmus et autres prog.)
Pour les étudiants du diplôme MASTER - NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS
Le rattrapage est autorisé (Note de rattrapage conservée)- Crédits ECTS acquis : 3 ECTS
Le coefficient de l'UE est : 3
Mots clés
modélisation, systèmes dynamiques, modèles SIR, modes de transmission, vecteurs, prévalence, résistance, prophylaxie, coévolutionSupport pédagogique multimédia